Bioinformatiker/ Bioinformatikerin (m/w/d) Genetische Forschung

Bioinformatiker/ Bioinformatikerin (m/w/d) – Genetische Forschung

Stellenbeschreibung

Die Stelle ist zum  in Voll- oder Teilzeitbeschäftigung mit mindestens 30 Wochenstunden bis zum  befristet zu besetzen. Die Vergütung erfolgt nach den Eingruppierungsvorschriften des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst (TV‑L) und ist bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen in die Entgeltgruppe 13 möglich.

Aufgabengebiet

• Entwicklung, Etablierung und Validierung bioinformatischer Softwarelösungen sowie Betreuung und Weiterentwicklung bestehender Datenflüsse und Analyse‑Pipelines zur Auswertung komplexer genetischer Daten
• Integration und Verknüpfung großer biologischer Datenbanken (z. B. über API‑Schnittstellen) zur effizienten Nutzung multidimensionaler Datensätze
• Eigenständige Analyse von Sequenzierdaten unterschiedlicher Plattformen (Illumina, Element Biosciences, Oxford Nanopore, Pacific Biosciences)
• Entwicklung und Anwendung von Methoden des maschinellen Lernens zur Interpretation genetischer, phänotypischer und funktionaler Daten (z. B. Pathway‑Analysen)
• Konzeption, Automatisierung und Validierung bioinformatischer Workflows zur Analyse von Next‑Generation‑Sequencing‑Daten
• Verfassen wissenschaftlicher Publikationen sowie aktive Mitarbeit an Verbundpublikationen und Drittmittelanträgen
• Engagierte Zusammenarbeit mit interdisziplinären Partnern und eigenverantwortliches Projektmanagement im Rahmen genetischer Diagnostik gemäß den Vorgaben des Qualitätsmanagement‑Handbuchs

Ihr Profil

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in Informatik, Biologie, Bioinformatik, Medizininformatik oder einer verwandten Disziplin
• Promotion erwünscht
• Erfahrung in der Analyse von Sequenzierdaten (z. B. Targeted Resequencing, RNA‑Seq, DNA‑Seq) und idealerweise Kenntnisse in Methoden des maschinellen Lernens
• Programmierkenntnisse in mindestens einer Sprache (z. B. Python, R, Java, Perl) sowie Bereitschaft zur Einarbeitung in Python
• Grundkenntnisse in Genetik und Erfahrung mit Pipeline‑ und Workflow‑Tools (z. B. Snakemake, Nextflow)
• Sicherer Umgang mit Linux‑ und HPC‑Umgebungen; Kenntnisse in containerbasierten Virtualisierungen (Docker, Singularity) und virtuellen Environments (conda, mamba)
• Erfahrung mit Versionierungssystemen (GitHub, GitLab)
• Grundkenntnisse in Datenschutz und Datensicherheit bei genetischen Daten; Wissen über Medizininformatik‑Standards (z. B. FHIR) ist von Vorteil
• Deutschkenntnisse sind nicht zwingend erforderlich, gute Englischkenntnisse sind Voraussetzung

Unser Angebot

• Attraktive Vergütung nach Tarifvertrag
• Vereinbarung von flexiblen Arbeitszeiten, um die Verbindung von Familie und Beruf in die Realität umzusetzen
• Berufsorientierte Fort‑ und Weiterbildungen mit individueller Planung Ihrer beruflichen Karriere und damit die Entwicklung eines zukunftsorientierten, individuellen beruflichen Profils
• Nutzung von betrieblichen Präventions‑ und Fitnessangeboten in unserem Gesundheitszentrum Carus Vital inkl. Teilnahme an Teamevents, Vorträgen, Kursen und Seminaren
• Betreuung Ihrer Kinder durch Partnerschaften mit Kindereinrichtungen in der Nähe des Klinikums
• Vorsorge für die Zeit nach der aktiven Berufstätigkeit in Form einer betrieblich unterstützten Altersvorsorge
• Nutzung von Bikeleasing und die Möglichkeit des Job‑Tickets
• Unterstützungsangebote für alle Lebensbereiche durch unser Familienbüro und die Mitarbeiterberatung
• Weitere Vorteile durch unsere Mitarbeitenden‑Benefits

HR‑Expertin für Recruiting bei Universitätsklinikum Carl Gustav Carus

Bioinformatician – Oncology (m/f/d) – Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ)

Doktorand Bioinformatik (m/w/d) – Technische Universität Dresden

(Junior) Data Analyst Waffensystemdaten (m/w/d)

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