Bioinformatiker/ Bioinformatikerin (m/w/d) Genetische Forschung

Bioinformatiker/ Bioinformatikerin (m/w/d) Genetische Forschung

Die Stelle ist zum in Voll- oder Teilzeitbeschäftigung mit mindestens 30 Wochenstunden bis zum befristet zu besetzen. Die Vergütung erfolgt nach den Eingruppierungsvorschriften des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst (TV-L) und ist bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen in die Entgeltgruppe 13 möglich.

Ihr Aufgabengebiet

• Entwicklung, Etablierung und Validierung bioinformatischer Softwarelösungen sowie Betreuung und Weiterentwicklung bestehender Datenflüsse und Analyse-Pipelines zur Auswertung komplexer genetischer Daten

• Integration und Verknüpfung großer biologischer Datenbanken (z. B. über API-Schnittstellen) zur effizienten Nutzung multidimensionaler Datensätze

• Eigenständige Analyse von Sequenzierdaten unterschiedlicher Plattformen (Illumina, Element Biosciences, Oxford Nanopore, Pacific Biosciences)

• Entwicklung und Anwendung von Methoden des maschinellen Lernens zur Interpretation genetischer, phänotypischer und funktionaler Daten (z. B. Pathway‑Analysen)

• Konzeption, Automatisierung und Validierung bioinformatischer Workflows zur Analyse von Next‑Generation‑Sequencing‑Daten

• Verfassen wissenschaftlicher Publikationen sowie aktive Mitarbeit an Verbundpublikationen und Drittmittelanträgen

• Engagierte Zusammenarbeit mit interdisziplinären Partnern und eigenverantwortliches Projektmanagement im Rahmen genetischer Diagnostik gemäß den Vorgaben des Qualitätsmanagement‑Handbuchs

Passt perfekt - Ihr Profil

• abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in Informatik, Biologie, Bioinformatik, Medizininformatik oder einer verwandten Disziplin
• Promotion erwünscht
• Erfahrung in der Analyse von Sequenzierdaten (z. B. Targeted Resequencing, RNA-Seq, DNA-Seq) und idealerweise Kenntnisse in Methoden des Maschinellen Lernens
• Programmierkenntnisse in mindestens einer Sprache (z. B. Python, R, Java, Perl) sowie Bereitschaft zur Einarbeitung in Python
• Grundkenntnisse in Genetik und Erfahrung mit Pipeline- und Workflow‑Tools (z. B. Snakemake, Nextflow)
• Sicherer Umgang mit Linux- und HPC‑Umgebungen ; Kenntnisse in containerbasierten Virtualisierungen (Docker, Singularity) und virtuellen Environments (conda, mamba)
• Erfahrung mitVersionsverwaltungssystemen (GitHub, GitLab)
• Grundkenntnisse in Datenschutz und Datensicherheit bei genetischen Daten; Wissen überMedizininformatik-Standards (z. B. FHIR) ist von Vorteil
• Deutschkenntnisse sind nicht zwingend erforderlich, gute Englischkenntnisse sind Voraussetzung

Überzeugt auf ganzer Linie – Unser Angebot

• attraktive Vergütung nach Tarifvertrag
• Vereinbarung von flexiblen Arbeitszeiten, um die Verbindung von Familie und Beruf in die Realität umzusetzen
• Berufsorientierten Fort- und Weiterbildungen mit individueller Planung Ihrer beruflichen Karriere und damit die Entwicklung eines zukunftsorientierten, individuellen beruflichen Profils
• Nutzung von betrieblichen Präventions‑ und Fitnessangeboten in unserem Gesundheitszentrum Carus Vital inkl. Teilnahme an Teamevents, Vorträgen, Kursen und Seminaren
• Betreuung Ihrer Kinder durch Partnerschaften mit Kindereinrichtungen in der Nähe des Klinikums
• Vorsorge für die Zeit nach der aktiven Berufstätigkeit in Form einer betrieblich unterstützten Altersvorsorge
• Nutzung von Bikeleasing und die Möglichkeit des Job‑Tickets
• Unterstützungsangebote für alle Lebensbereiche durch unser Familienbüro und die Mitarbeiterberatung
• Weitere Vorteile durch unsere Mitarbeitenden‑Benefits

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