Doktorand/ Doktorandin (m/w/d) im Institut für Medizinische Informatik und Biometrie

im Institut für Medizinische Informatik und Biometrie

Die Stelle ist zum in Teilzeit mit 26 Wochenstunden für 3 Jahre befristet zu besetzen.Die Vergütung erfolgt nach den Eingruppierungsvorschriften des jeweiligenTarifvertragesund ist bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen in die Entgeltgruppe E13 möglich.

Das Institut für Medizinische Informatik und Biometrie (IMB) ist Teil der Medizinischen Fakultät Carl Gustav Carus der Technischen Universität Dresden. Die Forschungsschwerpunkte des Instituts liegen in den Bereichen Systembiologie/-medizin und mathematische Modellierung, Medizinische Informatik und medizinische Biometrie und Bioinformatik. Neben diesen wissenschaftlichen Tätigkeitsfeldern bietet das IMB verschiedene Dienstleistung (z.B. Beratungs- und Weiterbildungsangebote zu biometrischen/bioinformatischen Themen) für Mitarbeitende und Studierende der Medizinischen Fakultät und des Universitätsklinikums Dresden an.

Wir freuen uns auf Ihre aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen (Anschreiben, Motivationsschreiben, Lebenslauf, Zeugnisse, falls vorhanden Publikationsliste, Angabe von zwei Referenzen).

Vorabinformationen erhalten Sie telefonisch von Herrn PD Dr. Michael Seifert unter oder per E-Mail:

Braucht Ihr ganzes Können - Ihr Aufgabengebiet:

Entwicklung und Anwendung einer bioinformatischen Analysepipeline für Eierstockkrebs-Exomsequenzierungsdaten: Sie integrieren, passen an und kombinieren bestehende bioinformatische Verfahren, um Tumorklone zu identifizieren und deren gemeinsame Entwicklung bei individuellen Patientinnen zu rekonstruieren. Ziel ist es, die evolutionäre Entstehung und Ausbreitung von Eierstockkrebs besser zu verstehen und relevante Gene und Signalwege im evolutionären Kontext zu identifizieren, die zukünftig als Ansatzpunkte für verbesserte Überwachung und Therapie dienen könnten. Ihre Arbeit bildet dabei eine zentrale Grundlage für die experimentellen Analysen des Projektpartners an der Klinik und Poliklinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe des Universitätsklinikums Dresden

evolutionäre Tumordatenanalyse: Identifikation von Tumorklonen und Rekonstruktion ihrer gemeinsamen Entwicklung bei Patientinnen

Gen- und Signalweg-Analyse: Untersuchung evolutionärer Zusammenhänge zur Identifikation neuer Therapieansätze

Integration bestehender Methoden: Anpassung und Zusammenführung bereits verfügbarer bioinformatischer Verfahren

Wissenschaftliche Kommunikation: Aufbereitung und Bereitstellung der Analyseergebnisse für experimentelle Projektpartner sowie Präsentation auf Tagungen

Projekt- und Publikationsarbeit: Mitwirkung an Berichten, Drittmittelanträgen, Publikationen und Doktorarbeit; eigenständige wissenschaftliche Arbeit zur Weiterqualifikation

• abgeschlossenes Hochschulstudium in Bioinformatik, Informatik oder verwandten Disziplinen
• sehr gute Masterarbeit im Bereich Bioinformatik / Datenanalyse
• erste Erfahrung in bioinformatischen Methoden für molekulare Omics-Daten (vorteilhaft: Exomsequenzierungsdaten)
• solide Programmiererfahrung, sehr gute Kenntnisse in R und Python
• sehr gute Englischkenntnisse
• vorteilhaft: Kenntnisse in Tumorbiologie, Tumorevolution und maschinellem Lernen sowie Erfahrung mit Linux und Computer-Servern

Überzeugt auf ganzer Linie - Unser Angebot:

• Vergütung: nach Tarifvertrag sowie eine feste Jahressonderzahlung und eine betriebliche Altersvorsorge
• Urlaub: 30 Tage
• Karriere und Weiterentwicklung: Zahlreiche interne und externe Weiterentwicklungs- und Weiterbildungsmöglichkeiten z. B. über unsere Carus Akademie
• Vereinbarkeit von Familie und Beruf: Unser Familienbüro berät und unterstützt in jeder Lebenslage, u. a. bei Kita-Belegplätzen rund um das Klinikum, Ferienprogrammen oder der Pflege von Angehörigen
• Gesundheit: Umfangreiche Sport- und Bewegungsangebote in unserem topmodernen Fitnessstudio sowie Programme und Beratung zur mentalen Gesundheit, betriebliches Gesundheitsmanagement u. v. m.
• Einkaufsvorteile: Mitarbeiterrabatt in unserer Klinikapotheke, Corporate Benefits und weitere Shoppingportale