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Post-Doktorand/-in (m/w/d) für den Bereich "Künstliche Intelligenz in der Genomik"
Einsatzort : Zentrum für Humangenetik und Genommedizin
Arbeitszeit : 100% der vollen tariflich vereinbarten Arbeitszeit (zzt. 38,5 Std./W.)
Befristung: zunächst unter Berücksichtigung des WissZeitVG für 3 Jahre, eine Verlängerung wird angestrebt
Einstieg: zum nächstmöglichen Zeitpunkt
Vergütung: EG 13 (TV-L)
Projekt:
Ziel des Projektes ist die Entwicklung robuster Datenanalyse-Pipelines zur Verarbeitung von multimodalen Gesundheitsdaten. Der Schwerpunkt liegt dabei auf der Implementierung folgender Teilaspekte:
- Multimodale Lernansätze: Die Entwicklung von KI-Modellen zur Fusion verschiedenartiger Datentypen (genetische Signatur, klinisches Profil) mit dem Ziel der Identifizierung präziser diagnostischer oder prognostischer Biomarker.
- Kohortenanalysen : Durchführung statistisch fundierter Analysen großer Patientenkollektive, um Erkenntnisse über Risikofaktoren und Therapieansätze zu gewinnen.
- Data-Engineering: Weiterentwicklung und Optimierung der vorhandenen Datenarchitektur und die Verbesserung des Datenaustauschs zwischen verschiedenen Forschungsgruppen.
Große genomische und klinische Datensätze sollen genutzt werden, um:
- Genetische Varianten effizient zu klassifizieren
- Krankheitsassoziierte Muster zu identifizieren
- Die Interpretation von Sequenzdaten (z. B. NGS) zu verbessern
- Vorhersagemodelle für genetische Erkrankungen zu entwickeln
- Biomarker mit therapeutischer oder prognostischer Relevanz zu identifizieren
Die Arbeit erfolgt in enger Zusammenarbeit mit klinischen und molekulargenetischen Arbeitsgruppen und trägt zur Weiterentwicklung personalisierter Medizin bei.
Aufgaben:
- Entwicklung, Implementierung und Evaluation von Machine-Learning-Algorithmen (z.B. Deep Learning, Klassifikationsmodelle, Agentensysteme etc.)
- Analyse und Integration komplexer genomischer Datensätze
- Datenaufbereitung und - visualisierung
- Teilnahme an wissenschaftlichen Konferenzen
- Mitwirkung an Drittmittelprojekten
Profil:
- Abgeschlossenes naturwissenschaftliches Hochschulstudium (Diplom, Master oder vergleichbar) in Bioinformatik, Informatik, Biologie, Molekularbiologie, Biochemie oder verwandte Disziplinen sowie abgeschlossene Promotion
- Solide Kenntnisse in Machine Learning / Statistik
- Sicherer Umgang mit gängigen Programmiersprachen, insbesondere Python
- Erfahrung im Umgang mit klinischen oder biomedizinischen Datensätzen
- Erfahrung im Aufsetzen und Verwalten von relationalen Datenbanken
- Grundverständnis genomischer Datenanalysen
- Wünschenswert:
- Wissenschaftliches Interesse an Humangenetik
- Erfahrung mit Deep Learning Frameworks (z.B. TensorFlow, PyTorch)
- Erfahrung mit LLM-Frameworks und Orchestrierungssystemen (z. B. LangChain oder vergleichbare Frameworks)
- Erfahrung mit Basismodellen und deren Anwendungen und Anpassungen (Fine-Tuning, Prompt Engineering, Parameter-efficient tuning wie LoRA/Adapters)
- Kenntnisse in Next-Generation Sequencing (NGS) Datenanalyse
- Erfahrung im High Performance Computing (HPC) Bereich
- Analytisches und strukturiertes Denkvermögen
- Hohe Motivation, teamorientiertes Arbeiten in einem interdisziplinären Umfeld
- Eigeninitiative sowie Einsatzbereitschaft, Organisation und Zuverlässigkeit
- Kreativität bei der Lösung komplexer Fragestellungen
Warum Sie sich für uns entscheiden sollten?
Wir bieten…
- 30 Tage Urlaub/ Jahr bei Vollzeitbeschäftigung
- Mitarbeitende werben Mitarbeitende für verschiedene Berufsgruppen / Prämie von 3.000 Euro
- Überdurchschnittliche betriebliche Altersversorgung der VBL
- Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
- Entspannter Arbeitsweg - vergünstigtes ÖPNV-Ticket oder Parkplatz sowie Möglichkeit der Teilnahme an der GoFlux App
- Familienfreundliche Unternehmenskultur
- Betriebskindergarten , Kinderland
- flexible Arbeitszeitmodelle sowie
- vielfältige Beratungs- und Unterstützungsangebote zur Vereinbarkeit von Beruf und Familie durch die Personalbetreuung
- Eine Onboarding-App für neue Mitarbeitende
- Fit & Gesund - von Gesundheitsförderung bis Hochschulsport – wir haben alles für Sie
Unser stressfreier Bewerbungsprozess:
Schritt 1: Schnell und einfach bewerben - mit oder ohne Lebenslauf.
Schritt 2: Wir nehmen Kontakt auf und besprechen, ob wir noch weitere Unterlagen benötigen.
Schritt 3: Im persönlichen Gespräch lernen wir uns gegenseitig kennen.
Schritt 4: Wir haben ein Match - dann kommt das Vertragsangebot!
Schritt 5: Nach der Unterschrift starten wir mit dem Onboarding und organisieren alles für den ersten Arbeitstag.
Es gibt noch offene Fragen? Gerne trotzdem bewerben!
Wir beantworten alle Fragen in einem persönlichen Gespräch.
Wir freuen uns!