Data Manager (all genders) in Digital Cardiovascular Research in der Klinik für Kardiologie - U[...]

Am Universitären Herz- und Gefäßzentrum (UHZ) des Universitätsklinikums Hamburg-Eppendorf (UKE) denken wir klinische und translationale kardiovaskuläre Forschung direkt integriert in unsere tägliche Patientenversorgung. Unser Ökosystem verbindet umfassend phänotypisierte Kohortenstudien einschließlich Biobanking, strukturierte Nachuntersuchungen und moderne computergestützte Methoden.

Die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) hat Dr. med. Shinwan Kany in das renommierte Emmy Noether-Programm aufgenommen. Das neu eingerichtete Forschungsprojekt befasst sich mit dem Thema „Risikostratifizierung für Vorhofflimmern und Herzschwäche bei Menschen mit seltenen Kardiomyopathie-Genvarianten mithilfe neuer Methoden“. Das Projekt zielt darauf ab, großskalige epidemiologische Daten, Cloud-Infrastrukturen und maschinelles Lernen miteinander zu verknüpfen, um prädiktive Modelle für Hochrisikopatienten zu entwickeln.

Ihre Aufgaben

• Einrichtung und kontinuierliche Pflege des systematischen Zugriffs auf große genomische und phänotypische Datenbanken (insbesondere UK Biobank und All of Us).
• Verantwortung für das Datenmanagement sowie die Pipeline-Infrastruktur innerhalb dedizierter Cloud-Computing-Strukturen wie DNAnexus und der All of Us Cloud-Infrastruktur.
• Strukturierung und Harmonisierung der im klinischen Arbeitspaket (WP4) erhobenen Register- und Patientendaten, einschließlich der Unterstützung bei der Pflege der TRUST-Kohorte.
• Koordination des datenschutzkonformen Datenaustauschs sowie des Rechtemanagements zwischen den Postdoktorand:innen und Doktorand:innen des Teams sowie der TRUST-Gruppe.
• Konzeption und Implementierung automatisierter Pipelines zur Qualitätssicherung und KI-gestützten Anomalieerkennung in heterogenen klinischen Datensätzen.
• Etablierung einheitlicher Code-Standards und Versionskontrollverfahren zur Sicherstellung einer reproduzierbaren Datenverarbeitung im Gesamtprojekt.

Wir freuen uns auf Ihren Lebenslauf, ein Motivationsschreiben, in dem Sie Ihre Interessen im Projekt sowohl aus technischer (Infrastruktur, Cloud-Computing) als auch aus klinischer Perspektive darlegen, Referenzprojekte, die Ihre fachliche Kompetenz im Datenmanagement belegen, sowie einer Beschreibung Ihres eigenen Beitrags zu diesen Projekten, und den Kontaktdaten von vorzugsweise drei Forschern, die sich bereit erklärt haben, Referenzschreiben zu verfassen.

Die Stelle ist auf drei Jahre befristet zu besetzen. Eine Verlängerung wird angestrebt und ist im zweiten Abschnitt des Emmy Noether Projekts bereits eingeplant.

Das bieten wir

• Faire und transparente Vergütung nach unserem Tarifvertrag TVöD/VKA (53.400 € - 82.100 €) unter Berücksichtigung von Qualifikationen und Berufserfahrung. Die Gehaltsangabe bezieht sich auf eine Vollzeitstelle mit 38,5 Wochenstunden. Die genannten Beträge sind Richtwerte und stellen kein Gehaltsversprechen dar.
• Gezielte und individuelle Weiterentwicklung auf Fach- und Projektebene ist gegeben, so bieten wir eine langfristige Perspektive in einem sinnstiftenden Umfeld.
• Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere.
• Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten.
• Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice; Option zum Dienstrad-Leasing.
• Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote.
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen.
• Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander.
• Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team.
• Unser Mitarbeitenden Restaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände.

Darauf freuen wir uns

• Abgeschlossene Berufsausbildung: einschlägige IT-Fachrichtung oder abgeschlossenes Hochschulstudium: einschlägige Fachrichtung, dann Bsp: in Data Science, (Bio-)Informatik, (Bio-)Statistik oder einem eng verwandten quantitativen Fachgebiet oder gleichwertige Fähigkeiten und Erfahrungen.
• Technische Kompetenz in Data Science und Data Engineering, nachgewiesen durch eine GitHub-Präsenz, publizierte Fachbeiträge oder ein vergleichbares Projektportfolio.
• Erfahrung mit relationalen Datenbanken (z. B. PostgreSQL), Objektspeichern (z. B. MinIO) sowie Versionskontrollsystemen inklusive CI/CD-Pipelines mit Git und GitLab.
• Sicherer Umgang mit den für die Datenanalyse relevanten Programmiersprachen, insbesondere Python und R.
• Echte Neugierde für die klinische kardiovaskuläre Medizin, intrinsische Motivation, ergebnisorientiertes Arbeiten sowie ausgeprägte Fähigkeiten im Selbstmanagement.
• Hervorragende Kommunikationsfähigkeiten in Deutsch und Englisch sowie die Fähigkeit, als effektive Schnittstelle zwischen technischen und klinischen Partnern zu agieren.

Wünschenswert

• Erfahrung mit Datenstandards für klinische Studien (z. B. CDISC SDTM/ADaM) und/oder medizinischen Ontologien (SNOMED CT, LOINC).
• Nachweisbare praktische Erfahrung in der Administration von Linux-basierten Forschungsinfrastrukturen oder Workload-Automatisierung.

Über uns

Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt

Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, ethnischer und sozialer Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt.

Hier mehr zum Thema „Diversity im UKE“ erfahren.